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e-PCR - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 e-PCR

这是命令 e-PCR,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

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e-PCR — 在 DNA 序列中查找序列标记位点 (STS)

概要


聚合酶链反应 [-HV] [posix-选项] sts文件 [法斯塔 ...] [兼容选项]

商品描述


该程序在基因组上的成对引物位置替换blast
产生 PCR 产物。

配置


posix 选项是:

-米=## 边距(默认 50)

-w=## 字号(默认 7)

-n=## 允许的最大不匹配(默认为 0)

-g=## 允许的最大插入次数(默认为 0)

-f=## 使用 ## 不连续的词,如果 ##>1 则慢

-o=## 设置输出文件

-t=## 设置输出格式:

1 - 经典,范围 (pos1..pos2)

2 - 经典,中点

3 - 表格

4 - 在注释中对齐的表格(慢)

-d=##-## 设置默认大小范围(默认 100-350)

-p =+- 打开/关闭点击后处理

-v=## 详细标志

-a=一个| f 使用预大小对齐(仅当 gaps>0 时),慢

a - 始终或 f - 作为后备

-x=+- 使用引物的 5' 端小写掩码(默认 -)

-u=+- 大写所有引物(默认 -)

compat-options(重复的 posix-options)是

M=## 边距(默认 50)

W=## 字号(默认 7)

N=## 允许的不匹配数(默认为 0)

G=## 允许的最大插入次数(默认为 0)

F=## 使用##不连续词

O=## 将输出文件设置为##

T=## 设置输出格式 (1..3)

D=##-## 设置默认尺寸范围

P=+- 后处理命中开/关

V=## 详细标志

A=一个| f 使用预大小对齐(仅当 gaps>0 时),慢

a - 始终或 f - 作为后备

X=+- 使用引物的 5' 端小写掩码(默认 -)

U=+- 大写所有引物(默认 -)

-中 与 T=2 相同

有关更多选项的信息,请致电 聚合酶链反应 没有任何选择。

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