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ecogrep - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 ecogrep

这是可以使用我们的多个免费在线工作站之一(例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器)在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行的命令 ecogrep

程序:

您的姓名


ecogrep - 基于分类 id 过滤器和正则表达式过滤 ecoPCR 结果
模式

概要


生态链 [选项] 文件名

商品描述


ecoPCR 是由 LECA 和 Helix-Project 开发的电子 PCR 软件。 它有助于
估计条码引物的质量。

该程序属于 exoPCR 包。

配置


-1 : [FIRST] : 将给定的模式与直接链寡核苷酸进行比较

-2 : [SECOND] : 将给定的模式与反向链寡核苷酸进行比较

-d : [D] 包含分类信息的数据库

-e :[E] 错误:模式匹配中允许的最大错误(选项 1, -2-p) (0 由
默认)

-p : [P] 模式 : 寡核苷酸模式

-h : [H]elp : 打印帮助

-i : [I] 忽略给定分类 ID 下的子树

-r : [R] 限制搜索到给定分类 ID 下的子树

-v : in[V]ert匹配意义,选择不匹配的行。

参数:
ecoPCR 输出文件名

使用 onworks.net 服务在线使用 ecogrep


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