这是 edialigne 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
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edialign - 序列的局部多重比对
概要
编辑 -序列 序列集 -nuc模式 名单 -revcomp 布尔 [-重叠 选择]
[-连锁 名单[-maxfragl 整数] -碎片 布尔 -fragsim 整数
[-它的分数 布尔[-临界点 浮动] -面具 布尔 -dostars 布尔
-星号 整数 -输出文件 输出文件 -outseq 后序器
编辑 -救命
商品描述
编辑 是来自 EMBOSS(“欧洲分子生物学公开赛”)的命令行程序
软件套件”)。 它是“Alignment:Multiple”命令组的一部分。
配置
输入 部分
-序列 序列集
额外 部分
-nuc模式 名单
核酸序列比对模式(简单、翻译或混合) 默认值:n
-revcomp 布尔
默认值:N
-重叠 选择
默认情况下,当 Nseq =<35 时使用重叠权重,但您可以将其设置为 'yes' 或
'no' 默认值:default(当 Nseq == 35 时)
-连锁 名单
构建序列树的聚类方法(UPGMA、最小链接或最大
联动)默认值:UPGMA
-maxfragl 整数
默认值:40
-碎片 布尔
默认值:N
-fragsim 整数
默认值:4
-它的分数 布尔
默认值:N
-临界点 浮动
默认值:0.0
输出 部分
-面具 布尔
默认值:N
-dostars 布尔
默认值:N
-星号 整数
默认值:4
-输出文件 输出文件
-outseq 后序器
使用 onworks.net 服务在线使用 edialigne