这是 fuzzproe 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
您的姓名
fuzzpro - 搜索蛋白质序列中的模式
概要
模糊专业 -序列 后继 -模式 模式 -输出文件 报告
模糊专业 -救命
商品描述
模糊专业 是来自 EMBOSS(“欧洲分子生物学公开赛”)的命令行程序
软件套件”)。 它是“Protein:Motifs”命令组的一部分。
配置
输入 部分
-序列 后继
-模式 模式
使用氨基酸的标准 IUPAC 单字母代码。 符号“x”是
用于接受任何氨基酸的位置。 歧义由
列出给定位置可接受的氨基酸,在方括号之间 '[
]'。 例如:[ALT] 代表 Ala 或 Leu 或 Thr。 歧义也表示为
在一对大括号“{}”之间列出不被接受的氨基酸
在给定的位置。 例如:{AM} 代表除 Ala 和 Met 之外的任何氨基酸。
模式中的每个元素与其相邻元素用“-”分隔。 (可选在
fuzzpro)。 可以通过以下方式指示模式元素的重复
括号之间带有数值或数值范围的元素。 例子:
x(3)对应xxx,x(2,4)对应xx或xxx或xxxx。 当一个
模式仅限于序列的 N 端或 C 端,该模式
要么以“<”符号开头,要么分别以“>”符号结尾。 一个时期结束
图案。 (在 fuzzpro 中可选)。 例如,[DE](2)HS{P}X(2)PX(2,4)C
输出 部分
-输出文件 报告
使用 onworks.net 服务在线使用 fuzzproe