这是 gbrowse 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
您的姓名
GBrowse2 - 通用基因组浏览器
概要
libgbrowse-perl [-H]
安装
如果系统上安装了 Apache2,则软件已将其配置为将 URL 链接到
GB浏览目录。 需要重新启动 Apache 才能将其考虑在内。
配置在 /etc/gbrowse2/apache2.conf 文件中可用。
如果使用另一台 Web 服务器,则应参考 apache2 模板将 url 映射到
以同样的方式。
依赖
存在附加的可选 perl 依赖项以提供附加功能。 请参考
到 INSTALL 文件中的可选模块了解更多信息。
配置
浏览2 配置文件位于 /etc/gbrowse。 主要配置文件是
GBrowse.conf。 它包含全局配置元素。 具体配置文件
位于每个数据库的相同目录中。 有关更多详细信息,请参阅
GB浏览文档。
安装提供酵母基因组样本。
商品描述
GBrowse 是一个简单但高度
可配置的基于 Web 的基因组浏览器。 它是
通用模型生物系统数据库项目 (GMOD)。
它的一些特点:
* 同时鸟瞰和详细的基因组视图;
* 滚动、缩放、居中;
* 将任意 URL 附加到任何注释;
* 曲目的顺序和外观可由管理员和
最终用户;
* 按注释 ID、名称或评论搜索;
* 支持使用 GFF 格式的第三方注释;
* 设置在会话中持续存在;
* DNA 和 GFF 转储;
* 连接不同的数据库,包括BioSQL和Chado;
* 多语言支持;
* 第三方功能加载;
* 可定制的插件架构(例如运行 BLAST、转储和导入许多
格式,查找寡核苷酸,设计引物,创建限制图,
编辑特征)。
WEB 查看校区
可通过 URL 访问 GBrowse http://localhost/gbrowse2
使用 onworks.net 服务在线使用 gbrowse
