基因组音乐情节突变关系 - 云端在线

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基因组音乐图突变关系 - 绘制突变关系结果图
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本文档描述了基因组音乐情节突变关系版本 0.04 (2016-01-01 at
23:10:18)

概要

基因组音乐情节突变关系--输入矩阵=？ --输出-pdf=？
[--skip-zero-mut-samples] [--genes-to-plot=?] [--plot-genes-in-order-listed]

所需 争论

输入矩阵 串
突变关系工具生成的基因/样本矩阵

输出-pdf 串
用于绘制绘图的输出 pdf 文件

不是必须的 争论

跳过零样本 布尔
不要绘制在绘制的任何基因上没有突变的样本

如果未指定，则默认值 'true'

noskip-zero-mut-样本 布尔
使跳过零mut-samples '假'

基因绘图 串
要绘制的以逗号分隔的基因列表（例如：DNMT3A、NPM1）

按顺序排列的绘图基因 布尔
按照列出的顺序绘制基因。 默认是按降序绘制它们
按突变数量排序

如果未指定，则默认值“false”（--noplot-genes-in-order-listed）

noplot-基因按顺序列出 布尔
使情节基因按顺序列出“假”

商品描述

给定一个使用“music mutation-relation --mutation-matrix-file”生成的矩阵，这个工具
将生成一个图，突出显示之间的相互排他性或同意
一组预定义基因的突变状态。

使用 onworks.net 服务在线使用 Genome-music-plot-mutation-relationp