这是 glam2 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
您的姓名
glam2 - 图案的缺口局部对齐
概要
魅力2 [选项] 字母 my_seqs.fa
一个字母以外的 p or n 被解释为字母文件的名称。
商品描述
GLAM2 是一个软件包，用于在序列中寻找基序，通常是氨基酸或
核苷酸序列。 一个motif是一个重复出现的序列模式：典型的例子是
TATA 盒和 CAAX 异戊二烯化基序。 GLAM2 的主要创新在于它允许
基序中的插入和删除。
配置 （默认 设置）
-h
显示所有选项及其默认设置。
-o
输出文件 （标准输出).
-r
比对运行次数（10).
-n
在没有改进的情况下在这么多次迭代后结束每次运行（10000).
-2
检查两条链 - 正向和反向互补。
-z
比对中的最小序列数（2).
-a
最小对齐列数 (2).
-b
最大对齐列数 (50).
-w
对齐列的初始数量 (20).
-d
狄利克雷混合文件。
-D
删除伪计数（0.1).
-E
不删除伪计数（2.0).
-I
插入伪计数（0.02).
-J
无插入伪计数（1.0).
-q
通用与序列集特定残基丰度的权重（1e + 99).
-t
初始温度 (1.2).
-c
每 n 次迭代的冷却因子 (1.44).
-u
温度下限 (0.1).
-p
在每次迭代时打印进度信息。
-m
每个站点采样移动的列采样移动 (1.0).
-x
站点采样算法： 0=快速 1=慢 2=快速傅里叶变换 (0).
-s
伪随机数的种子（1).
使用 onworks.net 服务在线使用 glam2
