这是 gmt-music-plot-mutation-relationp 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
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gmt 音乐图突变关系 - 为突变关系工具的结果绘制图
VERSION
本文档描述了 gmt 音乐情节突变关系版本 0.04 (2016-01-01 at
23:10:19)
概要
gmt 音乐情节突变关系 --input-matrix=? --输出-pdf=? [--skip-zero-mut-samples]
[--genes-to-plot=?] [--plot-genes-in-order-listed]
所需 争论
输入矩阵 串
突变关系工具生成的基因/样本矩阵
输出-pdf 串
用于绘制绘图的输出 pdf 文件
不是必须的 争论
跳过零样本 布尔
不要绘制在绘制的任何基因上没有突变的样本
如果未指定，则默认值 'true'
noskip-zero-mut-样本 布尔
使跳过零mut-samples '假'
基因绘图 串
要绘制的以逗号分隔的基因列表（例如：DNMT3A、NPM1）
按顺序排列的绘图基因 布尔
按照列出的顺序绘制基因。 默认是按降序绘制它们
按突变数量排序
如果未指定，则默认值“false”（--noplot-genes-in-order-listed）
noplot-基因按顺序列出 布尔
使情节基因按顺序列出“假”
商品描述
给定一个使用“music mutation-relation --mutation-matrix-file”生成的矩阵，这个工具
将生成一个图，突出显示之间的相互排他性或同意
一组预定义基因的突变状态。
使用 onworks.net 服务在线使用 gmt-music-plot-mutation-relationp
