这是 gmx-dielectric 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
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gmx-dielectric - 计算频率相关的介电常数
概要
gmx 电介质 [-f [<.xvg>][-d [<.xvg>][-o [<.xvg>][-c [<.xvg>]]
[-b [-e [-dt [-[现在]
[-xvg [-[没有]x1[-eint [-bfit ]
[-效益 [-尾巴 [-A [-tau1 ]
[-tau2 [-eps0 [-epsRF ]
[-固定 [-ffn [-nsmooth ]
商品描述
GMX 电介质 根据频率计算介电常数
模拟中总偶极矩的自相关函数。 这个 ACF 可以是
由...生成 GMX 偶极子. 可用函数的函数形式有：
· 一个参数：y = exp(-a_1 x),
· 两个参数：y = a_2 exp(-a_1 x),
· 三个参数：y = a_2 exp(-a_1 x) + (1 - a_2) exp(-a_3 x)。
拟合过程的起始值可以在命令行上给出。 也有可能
要将参数固定在其起始值，请使用 -固定 与您想要的参数编号
修理。
生成三个输出文件，第一个包含 ACF，对其进行指数拟合
具有 1、2 或 3 个参数，以及组合数据/拟合的数值导数。 这
第二个文件包含频率相关电介质的实部和虚部
常数，最后给出了一个称为 Cole-Cole 图的图，其中虚数
组件被绘制为实际组件的函数。 对于纯指数
松弛（Debyerelaxation） 后面的情节应该是一个半圆。
配置
指定输入文件的选项：
-f [<.xvg>] （dipcorr.xvg）
xvgr/xmgr 文件
指定输出文件的选项：
-d [<.xvg>] （派生.xvg）
xvgr/xmgr 文件
-o [<.xvg>] （epsw.xvg）
xvgr/xmgr 文件
-c [<.xvg>] （科尔.xvg）
xvgr/xmgr 文件
其他选项：
-b (0)
从轨迹读取的第一帧 (ps)
-e (0)
从轨迹读取的最后一帧 (ps)
-dt (0)
仅在 t MOD dt = 第一次 (ps) 时使用帧
-[现在 （否）
查看输出 .xvg, .xpm, .EPS 和 .pdb 档
-xvg
xvg 绘图格式：xmgrace、xmgr、无
-[没有]x1 （是）
使用第一列作为 x-axis 而不是第一个数据集
-eint (5)
是时候结束数据的整合并开始使用拟合了
-bfit (5)
开始合身时间
-效益 (500)
拟合结束时间
-尾巴 (500)
包括数据和拟合尾部的函数长度
-A (0.5)
拟合参数 A 的起始值
-tau1 (10)
拟合参数 tau1 的起始值
-tau2 (1)
拟合参数 tau2 的起始值
-eps0 (80)
你的液体的 epsilon0
-epsRF (78.5)
模拟中使用的反应场的 epsilon。 值 0 表示无穷大。
-固定 (0)
将参数固定在其起始值 A (2)、tau1 (1) 或 tau2 (4)
-ffn （无）
拟合函数：none、exp、aexp、exp_exp、exp5、exp7、exp9
-nsmooth (3)
平滑点数
使用 onworks.net 服务在线使用 gmx-dielectric
