这是 gmx-rama 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
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gmx-rama - 计算拉马钱德兰图
概要
gmx 拉玛 [-f [<.xtc/.trr/...>][-s [<.tpr>][-o [<.xvg>][-b ]
[-e [-dt [-[现在[-xvg ]
商品描述
GMX 拉玛 从拓扑文件中选择 phi/psi 二面体组合并计算
这些是时间的函数。 使用简单的 Unix 工具,例如 grep的 你可以选择
特定的残留物。
配置
指定输入文件的选项:
-f [<.xtc/.trr/...>] (traj.xtc)
弹道: 狂喜 TRR CPT 伟大 g96 资料库 TNG
-s [<.tpr>] (白杨.tpr)
便携式 xdr 运行输入文件
指定输出文件的选项:
-o [<.xvg>] (拉玛.xvg)
xvgr/xmgr 文件
其他选项:
-b (0)
从轨迹读取的第一帧 (ps)
-e (0)
从轨迹读取的最后一帧 (ps)
-dt (0)
仅在 t MOD dt = 第一次 (ps) 时使用帧
-[现在 (否)
查看输出 .xvg, .xpm, .EPS 和 .pdb 档
-xvg
xvg 绘图格式:xmgrace、xmgr、无
使用 onworks.net 服务在线使用 gmx-rama
