这是 gt-matchtool 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
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gt-matchtool - 解析匹配格式和/或调用匹配工具。
概要
gt 匹配工具 [选项 ...]
商品描述
-类型 [...]
选择匹配文件格式:OPENMATCH: 打开 匹配 格式,例如 vmatch BLASTOUT : 表格
BLAST 输出 (-m 8) BLASTALLP:使用blastp 调用BLASTALL BLASTALLN:调用BLASTALL
使用blastn BLASTP:调用blastp BLASTN:调用blastn LAST:调用LAST SW:使用
史密斯-沃特曼(默认:OPENMATCH)
-匹配文件 [文件名]
设置输入文件名(默认值:未定义)
-D b [文件名]
设置数据库文件名(默认:未定义)
-swminlen [折扣值]
设置所需的最小对齐长度(用于 Smith-Waterman 对齐)(默认值:10)
-swmaxedist [折扣值]
设置最大允许编辑距离(用于 Smith-Waterman 对齐)(默认值:0)
-询问 [文件名]
设置查询文件名(默认:未定义)
-救命
显示帮助并退出
-版
显示版本信息并退出
REPORTING BUGS
将错误报告给[电子邮件保护]>.
使用 onworks.net 服务在线使用 gt-matchtool