h5topng - 云端在线

程序：

您的姓名

h5topng - 从 HDF2 文件的二维切片生成 PNG 图像

概要

h5topng [OPTION]……[HDF5文件] ...

商品描述

h5topng 是一个实用程序，用于从 PNG（便携式网络图形）格式生成图像
HDF5 文件中数据集的二维切片。 它专为快速而肮脏的
科学数据的可视化，并通过 shell 脚本对其进行批处理。

HDF5 是由国家开发的免费、可移植的二进制格式和支持库
伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校超级计算应用中心。
一个单一的 h5 文件可以包含多个数据集； 默认情况下， h5topng 拿第一
数据集，但这可以通过 -d 选项，或使用语法
HDF5FILE:数据集.

对于三维或四维数据集，您必须在一个或两个切片中指定坐标
维度，分别得到一个二维切片，通过 -xyzt 选项。 还有更多
选项控制诸如颜色图和放大率之类的东西。 还是最基本的用法
类似于‘h5topng foo.h5’，它将输出一个包含图像的文件 foo.png
来自 foo.h5 中的二维数据。

配置

-h 显示有关命令行选项和用法的帮助。

-V 打印 h5topng 的版本号和版权信息。

-v 详细输出。 此输出包括在
数据，这有助于了解 -毫米 选项​​。

-o 文件
将 PNG 输出发送到 文件 而不是将 .h5 替换为 .png 的文件名
（默认）。

-x ix, -y iy, -z iz, -t it
这说明 h5topng 使用多维数据集的特定切片。 例如
-x 导致使用 yz 平面（3d 数据集的），在 x 索引处 ix （其中
索引从 XNUMX 到比该方向的最大索引小 XNUMX）。 这里，
x/y/z 对应于 HDF5 数据集的第一/第二/第三维度。 这 -t
选项指定最后一个维度中的一个切片，无论哪个可能是。 也可以看看
此 -0 将 x/y/z 切片坐标原点移动到数据集的选项
中央。

除了将单个索引指定为这些选项的参数之外，您还可以
以类似 Matlab 的表示法指定一系列索引： 开始:步:结束 or 开始:结束
(步 默认为 1)。 这会遍历该切片索引，从 开始 至 结束 分步
of 步, 生成一系列输出 PNG 文件（切片索引附加到
文件名，在“.png”之前）。

-0 将 x/y/z 切片坐标的原点移动到数据集中心，例如
-0 -x 0（或更紧凑的 -0x0）返回数据集的中心 x 平面
边 x 平面。 (-t 坐标不受影响。）

-X 鳞片, -Y 鳞片状, -S 规模
缩放图像的 x 和 y 维度 鳞片 和 鳞片状 分别。 的
-S 选项同时缩放 x 和 y。 默认使用比例因子 1.0； IE
图像与数据具有相同的尺寸（以像素为单位）。 线性插值是
用于在比例因子不是 1.0 时填充像素。

-s 歪斜
将图像倾斜 歪斜 （以度为单位）向左或向右。 结果是一个
平行四边形，（正方形）图像中的剩余空间填充
黑色或白色像素，取决于颜色图。

-T 转置数据（交换图像轴）。 默认情况下，第一个 (x)
数据的坐标对应列，第二个（y）坐标
对应于行； 换位颠倒了这个约定。

-c 颜色图
使用颜色图 颜色图 而不是默认值 灰色 颜色图（灰度渐变
从白到黑）。 颜色图 通常是颜色图之一的名称
提供 h5topng （在 /usr/share/h5utils/colormaps 目录中），或者可以
而是颜色映射文件的名称。

三个有用的包含颜色图是 热态 （黑-红-黄-白，适用于
强度数据）， 蓝红 （蓝白红，对签名数据有用），和 HSV (a
多色“彩虹”）。 如果您使用 蓝红 签名数据的彩色地图，您可以
也想用 -Z 选项，使色标的中心（白色）
对应于零。

颜色图文件是一系列以空格分隔的 RGBA 四元组，其中
每个值都在 0.0 到 1.0 的范围内，并表示
红/绿/蓝/阿尔法。 （0 的 alpha 是透明的，1 是不透明的；这是
仅用于 -a 选项，下面。）颜色图中的颜色是线性的
根据需要进行插值以提供连续的色带。

-r 颠倒颜色图的顺序。 您也可以通过放置一个
“-”在颜色图名称之前 -c or -a 选项。

-Z 将色标以数据中的零值居中。

-m 分钟, -M 最大
通常，颜色图的底部和顶部对应最小值和最大值
数据中的值。 使用这些选项，您可以使底部和顶部
颜色图对应 分钟 和 最大 反而。 低于或高于此范围的数据值
将被视为 分钟 or 最大 分别。 另见 -Z 和 -R
选项​​。

-R 当指定多个文件时，设置颜色图的底部和顶部
根据所有数据的最小值和最大值。 这有助于处理
许多文件使用一致的颜色比例，否则比例设置为
每个文件单独。

-C 文件, -b VAL
从第一个数据集中叠加轮廓轮廓 文件 所有的 HDF5 文件
输出图像。 （如果等高线数据集的维度与
输出数据，它在输出上定期“平铺”。）您可以使用
句法 文件：数据集 指定文件中的特定数据集。 轮廓
轮廓大约是一个值 VAL （默认为值范围的中间值 文件).

-A 文件, -a 颜色图:不透明
半透明地覆盖第一个数据集中的数据 文件 HDF5 文件，其中
在所有输出图像上，应该具有与输入数据集相同的维度，
使用颜色图 颜色图 不透明度（从 0 表示完全透明到 1
完全不透明） 不透明 乘以不透明度 (alpha) 值
颜色图。 （如果叠加数据集与输出的维度不同
数据，它在输出上定期“平铺”。）您可以使用语法
文件：数据集 指定文件中的特定数据集。

一些特别适用于此功能的预定义颜色图是 黄色
（透明白色至不透明黄色） 灰色 （透明白色至不透明黑色）， 亚尔
（透明黑色到不透明白色）， 墨绿色 （透明白色至不透明绿色），以及
蓝红 （不透明的蓝色到透明的白色到不透明的红色）。 您可以在前面加上“-”
颜色图名称以反转颜色图顺序。 （也可以看看 -c, 以上。）
默认为 -a 是黄色：0.3（黄色颜色图乘以 30% 不透明度）。

-d 姓名
使用数据集 姓名 从输入文件； 否则，每个文件的第一个数据集
用来。 或者，使用语法 HDF5FILE:数据集，这可以让你
为每个文件指定不同的数据集。 您可以使用 h5ls 命令（包括
使用 hdf5) 在文件中查找数据集的名称。

-8 对 PNG 输出使用 8 位（索引）颜色，而不是 24 位（直接）颜色（
默认）。 （这会略微缩小图像尺寸，但在
质量。）不支持与 -A （半透明覆盖）选项。

使用 onworks.net 服务在线使用 h5topng