这是命令 hmm-assembler.pl,可以使用我们的多个免费在线工作站之一(例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器)在 OnWorks 免费托管提供商中运行
程序:
您的姓名
hmm-assembler.pl - SNAP 模块 hmm-assembler.pl
概要
hmm-汇编程序.pl [-选项 [-更多选择]][--[程序_ARG1 ...]
配置
以下 单字符 选项 ,那恭喜你, 公认:
有参数: -i -e -A -D -M -S -C -I -N -a -3 -5 -Z -c
布尔值(无参数): -r -o -x -p -t -1
选项可以合并在一起。 -- 停止处理选项。 不需要空间
在选项和它们的参数之间。
选项:
-i [500]
-e [1000]
-A [0:30]
-D [0:9]
-M [0:15]
-S [0:9]
-C [4]
-I [4]
-N [4]
-3 []包含3'UTR模型,需要 -a
-a []包含PolyA模型,需要 -3
-5 [] 包含 5'UTR moel,需要 -p
-p 包括通用启动子模型,需要 -5
-r 包括通用重复模型
-o 包括反向ORF模型
-x 使用显式持续时间内含子模型
-t 包括线虫反式剪接,需要 -p, -5
-Z 设置进化枝特定值(蠕虫、苍蝇、植物)
-1 单基因模型
-c
包括 GC-AG 剪接供体模型
使用 onworks.net 服务在线使用 hmm-assembler.pl