这是命令 hmmstat，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
您的姓名
hmmstat - 显示配置文件的摘要统计信息
概要
哈姆统计 [选项]
商品描述
这个 哈姆统计 实用程序打印出每个配置文件的汇总统计表格文件
.
可能是“-”（破折号），在这种情况下，配置文件是从
管道而不是来自文件。
列是：
IDX 此配置文件的索引，在文件中从 1 开始编号。
姓名 配置文件的名称。
加入
配置文件的可选加入，如果没有，则为“-”。
序列号 估计配置文件的序列数。
eff_nseq
在 HMMER 之后估计轮廓的有效序列数
应用了有效的序列号计算，例如默认熵
加权。
M 模型在共有残基（匹配状态）中的长度。
柔和的 每个匹配状态的平均相对熵，以位为单位。 这是预期的（平均）分数
每个共识立场。 这是默认的熵加权方法
有效序列号估计侧重于，因此对于默认的 HMMER3 模型，您
期望此值反映熵加权的默认目标。
info 每个匹配状态的平均信息内容，以位为单位。 估计没啥用。
信息内容与相对熵的计算略有不同。
p 相关 平均位置相对熵，以位为单位。 这是 per- 的更高级版本
匹配状态相对熵，考虑到转换
（插入/删除）概率； 它可能是一个更准确的估计
每个模型共识位置贡献的平均分数。
康普KL 模型整体平均残留成分之间的 Kullback-Leibler 距离
和默认的背景频率分布。 这个数字越高，
轮廓的残留成分更偏向于。 高度偏向的配置文件可以
通过导致过多的非同源序列减慢 HMMER3 加速管道
通过过滤器。
配置
-h 帮助; 打印命令行用法和所有可用选项的简短提醒。
使用 onworks.net 服务在线使用 hmmstat
