Amazon Best VPN GoSearch

OnWorks 网站图标

kmc_tools-filter - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 kmc_tools-filter

这是 kmc_tools-filter 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

您的姓名


kmc_tools-filter - 过滤掉 k-mers 数量太少的读数

概要


kmc_工具 过滤 [kmc_input_db_params]
[input_read_set_params] [output_read_set_params]

商品描述


此命令过滤掉 k-mer 数量太少的读数。

配置


对于 k-mers 数据库,还有其他参数:

-ci
排除 k-mers 发生少于次

-cx
排除 k-mers 出现的次数超过次

对于读取的输入集,还有其他参数:

-ci
删除包含比值少的 k-mer 的读取。 它可以是整数或浮点数
在 [0.0;1.0] 范围内

-ci
删除包含比值更多的 k 聚体的读取。 它可以是整数或浮点数
在 [0.0;1.0] 范围内

-F
以 FASTA 格式 (-fa)、FASTQ 格式 (-fq) 输入; 默认值:FASTQ

对于读取输出集,还有其他参数:

-F
以 FASTA 格式 (-fa)、FASTQ 格式 (-fq) 输出; 默认值:与输入相同


kmc_tools 过滤器 kmc_db -ci3 input.fastq -ci0.5 -cx1.0 filters.fastq
kmc_tools 过滤器 kmc_db input.fastq -ci10 -cx100 过滤的.fastq

使用 onworks.net 服务在线使用 kmc_tools-filter


免费服务器和工作站

下载 Windows 和 Linux 应用程序

Linux 命令

Ad




×
广告
❤️在这里购物、预订或购买——免费,有助于保持服务免费。