这是 kmc_tools-union 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
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kmc_tools-union - 计算两个 KMC 数据库的并集
概要
kmc_工具 工会
商品描述
输出数据库将包含两个输入集中存在的所有 k-mer。 对于相同的
第一个和第二个输入中的 k-mers,输出中的计数器等于总和
从两个输入。
配置
每个输入都有额外的参数:
-ci
排除 k-mers 发生少于次
-cx
排除 k-mers 出现的次数超过次
对于输出,还有其他参数:
-ci
排除 k-mers 发生少于次
-cx
排除 k-mers 出现的次数超过次
-CS
计数器的最大值
例
kmc -k28 file1.fastq kmers1 tmp kmc -k28 file2.fastq kmers2 tmp kmc_tools union kmers1
-ci3 -cx70000 kmers2 kmers1_kmers2_union -cs65536
使用 onworks.net 服务在线使用 kmc_tools-union