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mia-2dmany2one-nonrigid - 云端在线

在 OnWorks 免费托管服务提供商中通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器运行 mia-2dmany2one-nonrigid

这是命令 mia-2dmany2one-nonrigid 可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

名称


mia-2dmany2one-nonrigid - 一系列二维图像的配准

概要


mia-2dmany2one-nonrigid -i -o [选项]

商品描述


mia-2dmany2one-nonrigid 该程序注册一个连续编号的集合的所有图像
图像到一个通用的用户定义参考。

配置


文件IO
-i --in-file=(输入,必填); 细绳
输入灌注数据集

-o --out-file=(输出,需要); 细绳
已注册图像的文件名、编号和图案将从
输入数据

报名参加
-O -​​-optimizer=gsl:opt=gd,step=0.1
用于最小化的优化器

-l --mg-levels=3
多分辨率级别多分辨率级别

-f --transForm=样条
转换类型转换类型有关支持的插件,请参阅
插件:2dimage/transform

-r --ref=-1
参考框架(-1 == 使用中间的图像)参考框架(-1 == 使用
中间的图)

-k --skip=0
在系列开始时跳过这些图像的注册skip
在系列开始时注册这些图像

帮助 & 详细信息
-V --verbose=警告
输出的详细程度,打印给定级别和更高优先级的消息。
从最低级别开始支持的优先级是:
info - 低级消息
追踪 - 函数调用跟踪
失败 - 报告测试失败
警告 - 警告
错误 - 报告错误
调试 - 调试输出
message - 普通消息
致命 - 只报告致命错误

- 版权
印刷版权信息

-h --帮助
打印此帮助

-? - 用法
打印一个简短的帮助

- 版
打印版本号并退出

加工
--线程=-1
用于处理的最大线程数,这个数字应该更低
或等于机器中逻辑处理器内核的数量。 (-1:
自动估计)。用于处理的最大线程数,这
number 应该小于或等于逻辑处理器内核的数量
机器。 (-1:自动估计)。

插件: 1d/样条bc


镜子 在边界上镜像的样条插值边界条件

(无参数)

重复 在边界处重复值的样条插值边界条件

(无参数)

样条插值边界条件假设外部值为零

(无参数)

插件: 一维/样条内核


样条 B-spline kernel创建,支持的参数有:

d = 3; [0, 5] 中的整数
样条度数。

妈妈们 OMoms-spline 内核创建,支持的参数有:

d = 3; [3, 3] 中的整数
样条度数。

插件: 2d图像/成本


公司 具有掩蔽支持的局部归一化互相关。,支持的参数
是:

w = 5; 输入 [1, 256]
用于评估局部十字的窗口的半宽
相关性。

LSD 最小二乘距离测量

(无参数)

mi 基于样条解析的互信息,支持的参数有:

= 0; 浮动在 [0, 40]
在高强度和低强度下切割的像素百分比
离群值。

宾士 = 64; 输入 [1, 256]
用于运动图像的直方图箱数。

内核 = [bspline:d=3]; 工厂
用于运动图像 parzen 直方图的样条内核。 对于支持的插件
见插件:1d/splinekernel

罗宾斯 = 64; 输入 [1, 256]
用于参考图像的直方图箱数。

内核 = [bspline:d=0]; 工厂
用于参考图像 parzen 直方图的样条内核。 对于支持的插件-
ins见PLUGINS:1d/splinekernel

NCC 归一化互相关。

(无参数)

ngf 该函数根据归一化梯度评估图像相似度
领域。 提供多种评估内核,支持的参数有:

评估 = ds; 字典
插件子类型。 支持的值是:
sq - 差的平方
ds - 尺度差的平方
- 标量乘积核
交叉 - 交叉产品内核

SSD 2D imaga cost:平方差之和,支持的参数有:

自动阈值 = 0; 浮动在 [0, 1000]
通过仅获取强度值来使用移动图像的自动屏蔽
到大于给定阈值的帐户。

规范 = 0; 布尔值
设置指标是否应按图像像素数进行归一化。

ssd-自动屏蔽
2D 图像成本:平方差的总和,基于给定的自动屏蔽
阈值,支持的参数有:

阈值 = 0; 双倍的
参考图像的阈值强度值。

阈值 = 0; 双倍的
源图像的阈值强度值。

插件: 2dimage/fullcost


图片 也处理多分辨率的广义图像相似性成本函数
加工。 实际的相似性度量被赋予 es 额外参数。,
支持的参数有:

成本 = 固态硬盘; 工厂
成本函数核。 有关支持的插件,请参阅 PLUGINS:2dimage/cost

调试 = 0; 布尔值
保存中间结果用于调试。

文献 =(输入,字符串)
参考图像。

SRC =(输入,字符串)
学习形象。

重量 = 1; 漂浮
成本函数的权重。

标签图像
映射两个图像的标签并处理标签的相似性成本函数
保留多分辨率处理,支持的参数有:

调试 = 0; [0, 1] 中的整数
将距离变换写入 3D 图像。

最大标签 = 256; [2, 32000] 中的整数
要考虑的最大标签数。

文献 =(输入,字符串)
参考图像。

SRC =(输入,字符串)
学习形象。

重量 = 1; 漂浮
成本函数的权重。

蒙面图像
广义掩码图像相似性成本函数也处理多
分辨率处理。 提供的面具应该是密集填充的区域
多分辨率处理,否则掩码信息可能会丢失
缩小图像时。 参考掩码和转换后的掩码
学习图像由二进制AND组合而成。 给出了实际的相似性度量
es 额外参数,支持的参数有:

成本 = 固态硬盘; 工厂
成本函数核。 有关支持的插件,请参阅
插件:2dimage/maskedcost

文献 =(输入,字符串)
参考图像。

参考掩码 =(输入,字符串)
参考图像掩码(二进制)。

SRC =(输入,字符串)
学习形象。

src-掩码 =(输入,字符串)
研究图像掩码(二进制)。

重量 = 1; 漂浮
成本函数的权重。

插件: 二维图像/IO


BMP BMP 2D 图像输入/输出支持

可识别的文件扩展名:.BMP、.bmp

支持的元素类型:
二进制数据,无符号 8 位,无符号 16 位

数据池 与内部数据池之间的虚拟 IO

可识别的文件扩展名:.@

迪康 DICOM 的 2D 图像 io

可识别的文件扩展名:.DCM、.dcm

支持的元素类型:
有符号 16 位,无符号 16 位

一个用于 OpenEXR 图像的 2dimage io 插件

可识别的文件扩展名:.EXR、.exr

支持的元素类型:
无符号 32 位,浮点 32 位

JPG 用于 jpeg 灰度图像的 2dimage io 插件

可识别的文件扩展名:.JPEG、.JPG、.jpeg、.jpg

支持的元素类型:
无符号 8 位

PNG 一个用于 png 图像的 2dimage io 插件

可识别的文件扩展名:.PNG、.png

支持的元素类型:
二进制数据,无符号 8 位,无符号 16 位

RAW 2D 图像输出支持

可识别的文件扩展名:.RAW、.raw

支持的元素类型:
二进制数据,有符号 8 位,无符号 8 位,有符号 16 位,无符号 16 位,
有符号 32 位、无符号 32 位、浮点 32 位、浮点 64


TIF TIFF 2D 图像输入/输出支持

可识别的文件扩展名:.TIF、.TIFF、.tif、.tiff

支持的元素类型:
二进制数据,无符号 8 位,无符号 16 位,无符号 32 位

远景 一个用于 vista 图像的 2dimage io 插件

可识别的文件扩展名:.V、.VISTA、.v、.vista

支持的元素类型:
二进制数据,有符号 8 位,无符号 8 位,有符号 16 位,无符号 16 位,
有符号 32 位、无符号 32 位、浮点 32 位、浮点 64


插件: 2dimage/maskedcost


公司 具有掩蔽支持的局部归一化互相关。,支持的参数
是:

w = 5; 输入 [1, 256]
用于评估局部十字的窗口的半宽
相关性。

mi 基于样条解析的带掩码的互信息,支持的参数有:

= 0; 浮动在 [0, 40]
在高强度和低强度下切割的像素百分比
离群值。

宾士 = 64; 输入 [1, 256]
用于运动图像的直方图箱数。

内核 = [bspline:d=3]; 工厂
用于运动图像 parzen 直方图的样条内核。 对于支持的插件
见插件:1d/splinekernel

罗宾斯 = 64; 输入 [1, 256]
用于参考图像的直方图箱数。

内核 = [bspline:d=0]; 工厂
用于参考图像 parzen 直方图的样条内核。 对于支持的插件-
ins见PLUGINS:1d/splinekernel

NCC 具有掩蔽支持的归一化互相关。

(无参数)

SSD 带掩蔽的平方差的总和。

(无参数)

插件: 2d 图像/变换


仿射 仿射变换(六自由度),支持的参数有:

图像边界 = 镜子; 工厂
图像插值边界条件。 有关支持的插件,请参阅
插件:1d/splinebc

图像内核 = [bspline:d=3]; 工厂
图像插值器内核。 有关支持的插件,请参阅
插件:1d/splinekernel

硬性 刚性变换(即旋转和平移,三度
自由),支持的参数有:

图像边界 = 镜子; 工厂
图像插值边界条件。 有关支持的插件,请参阅
插件:1d/splinebc

图像内核 = [bspline:d=3]; 工厂
图像插值器内核。 有关支持的插件,请参阅
插件:1d/splinekernel

旋转中心 = [[0,0]]; 2df向量
相对旋转中心,即<0.5,0.5>对应的中心
支持矩形。

回转 旋转变换(即围绕一个给定的中心旋转一度
自由),支持的参数有:

图像边界 = 镜子; 工厂
图像插值边界条件。 有关支持的插件,请参阅
插件:1d/splinebc

图像内核 = [bspline:d=3]; 工厂
图像插值器内核。 有关支持的插件,请参阅
插件:1d/splinekernel

旋转中心 = [[0,0]]; 2df向量
相对旋转中心,即<0.5,0.5>对应的中心
支持矩形。

仿样 可以由一组 B 样条系数描述的自由形式变换
和一个底层的 B 样条内核,支持的参数是:

茴香酸 = [[0,0]]; 2df向量
以像素为单位的各向异性系数率,非正值将是
被 'rate' 值覆盖..

图像边界 = 镜子; 工厂
图像插值边界条件。 有关支持的插件,请参阅
插件:1d/splinebc

图像内核 = [bspline:d=3]; 工厂
图像插值器内核。 有关支持的插件,请参阅
插件:1d/splinekernel

核心 = [bspline:d=3]; 工厂
转换样条内核.. 有关支持的插件,请参阅
插件:1d/splinekernel

罚款 =; 工厂
变换惩罚项。 有关支持的插件,请参阅
插件:2dtransform/splinepenalty

= 10; 浮动在 [1, inf)
以像素为单位的各向同性系数率。

翻译 仅平移(两个自由度),支持的参数有:

图像边界 = 镜子; 工厂
图像插值边界条件。 有关支持的插件,请参阅
插件:1d/splinebc

图像内核 = [bspline:d=3]; 工厂
图像插值器内核。 有关支持的插件,请参阅
插件:1d/splinekernel

vf 这个插件实现了一个转换,为每个定义了一个翻译
定义转换域的网格点。,支持
参数是:

图像边界 = 镜子; 工厂
图像插值边界条件。 有关支持的插件,请参阅
插件:1d/splinebc

图像内核 = [bspline:d=3]; 工厂
图像插值器内核。 有关支持的插件,请参阅
插件:1d/splinekernel

插件: 2d变换/样条惩罚


卷曲 divcurl 对转换的惩罚,支持的参数是:

卷曲 = 1; 浮动在 [0, inf)
卷曲的惩罚权重。

DIV = 1; 浮动在 [0, inf)
分歧的惩罚权重。

规范 = 0; 布尔值
如果惩罚应该相对于图像进行归一化,则设置为 1
大小。

重量 = 1; 浮在 (0, inf)
惩罚能量的权重。


将图像'inputXXXX.png'给出的图像系列注册到参考图像30。跳过两个
在开始时使用互信息作为代价函数,并惩罚
由权重为 5 的 divcurl 转换。将结果存储在“registeredXXXX.png”中。

mia-2dmany2one-nonrigid -i input0000.png -o 注册%04d.png -k 2 -r 30 图像:成本=mi
divcurl:权重=5

作者


格特·沃尔尼

版权


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绝对没有保证,您可以根据 GNU 的条款重新分发它
通用公共许可证版本 3(或更高版本)。 有关更多信息,请使用
选项“--版权”。

使用 onworks.net 服务在线使用 mia-2dmany2one-nonrigid


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