这是 micro_razers 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
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微型剃须刀
概要
micro_razers [选项]
商品描述
MicroRazerS 使用基于前缀的映射策略来映射可能的小 RNA 读数
包含 3' 接头序列。
(c) 版权所有 2009，Anne-Katrin Emde。
-h, - 帮帮我
显示此帮助消息。
- 版
显示版本信息
主要选项::
-o, - 输出 文件
更改输出文件名。 默认： 。结果。
-rr, --识别率 民
在 [80..100] 范围内设置百分比识别率。 默认值：100。
-sL, --种子长度 民
种子长度 在 [10..inf] 范围内。 默认值：16。
-sE, --种子错误
允许种子中有一个错误
-f, - 向前
map 只读取正向链。
-r, - 逆转
map 仅读取反向链。
-mN, --匹配-N
'N' 与所有其他字符匹配
-m, --最大命中 民
仅输出范围 [1..inf] 内的 NUM 最佳命中。 默认值：100。
-pa, --清除歧义
清除超过 max-hits 最佳匹配的读取
-lm, - 记忆不足
以运行时为代价减少内存使用
-v, --详细
详细模式
-vv, --详细
非常详细的模式
输出格式选项::
-的, - 输出格式 民
设置输出格式。 0 = MicroRazerS 格式，1 = SAM。 在 [0..1] 范围内。
-a, - 结盟
转储每个匹配项的对齐方式
-gn, --基因组命名 民
选择基因组的命名方式。 0 = 使用 Fasta id，1 = 从 1 开始枚举。
范围 [0..1]。 默认值：0。
-rn, --读取命名 民
选择读取的命名方式。 0 = 使用 Fasta id，1 = 从 1 开始枚举。
范围 [0..1]。 默认值：0。
-所以, - 排序 民
选择匹配项的排序方式。 0 = 读数，1 = 基因组位置。 在范围内
[0..1]。 默认值：0。
-pf, --位置格式 民
选择开始/结束位置编号（参见下面的坐标部分）。 0 = 间隙空间，
1 = 位置空间。 在 [0..1] 范围内。 默认值：0。
VERSION
micro_razers 版本：1.0.1 最后更新 2009 年 XNUMX 月
使用 onworks.net 服务在线使用 micro_razers
