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mincaverage - 平均 minc 文件

概要

矿工 [ ] .mnc [ .mnc...] .mnc

商品描述

矿工 平均 minc 文件在一起。 一系列可选行为是允许的
井：预标准化体积，创建标准偏差体积，平均
输入文件的指定维度。

配置

请注意，可以以缩写形式指定选项（只要它们是唯一的）和
可以在命令行的任何地方给出。

总类 选项

-2 创建一个 MINC 2.0 格式的输出文件。

-破坏者
覆盖现有文件。

-noclobber
不要覆盖现有文件（默认）。

-冗长
打印出复制的每个数据块的进度信息（默认）。

-安静的 不要打印出进度信息。

-调试 打印额外信息（例如标准化因子）。

-文件列表 文件名
指定包含输入文件名列表的文件。 如果给出“-”，则文件
名称是从标准输入读取的。 如果给出了这个选项，那么应该没有输入
在命令行中指定的文件名。 输入文件中的空行是
忽略了。

-max_buffer_size_in_kb 缓冲区大小
指定内部缓冲区的最大大小（以千字节为单位）。 默认值为 4096
千字节。

输出 类型 选项

这些选项控制单个体素值的存储精度和大小
输出文件。

-文件类型
不要做任何类型转换（默认）。

-字节 写出 8 位整数值。

-短 写出 16 位整数值。

-int 写出 32 位整数值。

-长 由 -int 取代。

-漂浮 写出单精度浮点值。

-双
写出双精度浮点值。

-签 将值写为有符号整数（短和长的默认值）。 被忽略
浮点类型。

-未签名
将值写为无符号整数（字节的默认值）。 忽略浮动
点类型。

-范围 分钟 最大
在整数表示中指定输出体素值的有效范围。
默认是类型和符号的完整范围。 此选项被忽略
浮点值。 要使其产生任何效果，您必须指定一个类型。

平均 选项

-标准化
在对它们求平均值之前将它们标准化为它们的全局平均值（基于平均值
值大于最小值的全范围 2% 的体素）。

-不规范化
不标准化卷（默认）。

-sd文件 sd文件.mnc
指定输出标准差文件的名称，要另外计算
通常计算的平均值。

-权重文件 权重文件
指定输出累积体素权重文件（默认值=无）。

-复制头
从第一个输入文件中复制所有附加头信息（默认
对于一个输入文件）。

-无复制头
不要复制额外的头信息（许多输入文件的默认值）。

-平均亮度 名称
指定我们应该对其进行平均（或计算）的维度的名称
标准差）。 如果进行了归一化，它仍然只适用于分离
仅文件 - 在文件中不进行规范化。

-二值化
在计算平均值之前对输入体积进行二值化。 二值化完成
通过指定对平均值贡献 1 的值范围。 归一化
执行二值化时不允许输入。

-bin范围 分钟 最大
指定二值化的值范围。

-二进制值 折扣值
为二值化指定单个合法值（整数）。 范围设置为 +/-
0.5 围绕此值实现输入值的有效舍入。

-ignore_below 折扣值
不要在平均值和 sd 中包含低于此值的体素

-ignore_above 折扣值
不要在平均值和 sd 中包含高于此值的体素

-地板 折扣值
同义词 -ignore_below

-ignore_above 折扣值
同义词 -ignore_above

重量
指定一系列用于平均的权重。 权重值的数量必须
匹配输入文件的数量，并且值必须作为单个提供
以逗号或空格作为分隔符的参数。 权重的总和必须是非
零。 如果权重与平均维度一起使用，则只有一个输入文件可以
被指定。

-宽度加权
此选项只能在跨维度求平均时使用 (-平均亮度 选项）。 它
指定应使用对应的宽度变量进行加权
到平均维度。 例如，使用 -宽度加权 -平均亮度 次
将使用时间宽度变量对值进行加权。

-最小重量 折扣值
这指定了最小重量（如果未指定重量，则为体积数）
需要计算一个有效的平均值。 如果体素的累积权重为
低于此阈值，报告的平均值和标准差将为 0。这通常会
如果使用以下任何一项排除值，则很有用 -忽略 选项，或按 NaN 值
在输入卷中。

-最小权重分数 折扣值
与...一样 -最小重量，但指定为输入权重总和的一部分
（或输入体积的数量，如果未指定重量）。

通用 选项 所有 命令：

-救命 打印命令行选项的摘要并退出。

-版
打印程序的版本号并退出。

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