这是命令 qualityScores,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
您的姓名
qualityScores - subread 套件的一个组件
用法
质量分数 [选项] -i -o
必需的参数:
-i
输入文件的名称,包括读取的数据。 默认格式为 Fastq。
-o
输出文件的名称,它是一个文本文件,包括每个读取碱基的 Phred 分数。
可选参数:
--gzFASTQ输入 输入文件采用 gzip 压缩的 Fastq 格式。
--BAM输入
输入文件为 BAM 格式。
--SAM输入
输入文件为 SAM 格式。
--首尾
在双端数据中仅使用第一次读取。 仅适用于双端 BAM/SAM
输入。
--第二端
在双端数据中仅使用第二次读取。 仅适用于双端 BAM/SAM
输入。
--计数读取 要从输入中提取的读取总数
文件。 默认为 10,000。
--phred-偏移量 <33|64> 指的是 subread aligner。
使用 onworks.net 服务在线使用 qualityScores