这是命令 snp-sites，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
您的姓名
snp-sites - 从多 fasta 对齐文件中查找 snp 站点
概要
snp_站点 [-mvph] [-o output_filename] [输入文件]
商品描述
此应用程序采用多 fasta 比对，找到所有 SNP 位点，然后输出
以下任一格式的 SNP 位点：
多 fasta 对齐、VCF、宽松的 phylip 格式。
配置
-m
输出多 fasta 对齐文件（默认）
-v
输出一个 VCF 文件
-p
输出一个 phylip 文件
-o
指定输出文件名
-h
这个文件
-V
显示版本并退出
示例
snp 站点 my-alignment.aln
snp-站点 my-gzipped-alignment.aln.gz
FORMAT OF “ INPUT 文件
输入文件应如下所示：
>reference_sequence
accggtt
>comparison_sequence
AACCGGTT
>another_comparison_sequence
美国ACCGCTT
有关更多示例，请访问：
https://github.com/sanger-pathogens/snp_sites/tree/master/tests/data
使用 onworks.net 服务在线使用 snp 站点
