这是 ugene 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
您的姓名
尤金 - 集成的生物信息学套件
概要
尤金 -用户界面
尤金 [配置]
商品描述
尤金 是用于 DNA 和蛋白质序列分析的跨平台环境。 尤金
集成了最流行的生物信息学计算算法并提供 GUI
和命令行界面，用于执行基因组数据的复杂分析。
主要特点 尤金:
* 查看和分析带注释的 DNA 或蛋白质序列
* 色谱图可视化和编辑
* 用于 PDB 和 MMDB 格式文件的集成 3D 查看器
* 集成支持对 NCBI 数据库的搜索请求
* 使用 MUSCLE3、MUSCLE4 和 KAlign 进行多序列比对
* HMM 配置文件构建和搜索，基于 HMMER2 和 HMMER3 的来源
* 基于 GORIV 和 PsiPred 的现代蛋白质二级结构预测算法
* 使用 Phylip 进行系统发育分析
* PCR引物设计使用Primer3包
* 计算机克隆
* 使用 SITECON 在 DNA 序列中搜索转录因子结合位点
* 搜索限制性内切酶并与 REBASE 集成
* 搜索直接和反向重复
* 使用 Bowtie 进行 DNA 参考组装
* 蛋白质回译
* 搜索 ORF
* 设计复杂的计算工作流和查询
尤金 具有模块化结构，几乎所有功能都包含在插件中。
内部 尤金 设计支持并行性以从使用中获利
多核计算机。 中的每个计算任务 尤金 在后台执行并执行
不会阻止用户与图形界面的交互。
配置
-用户界面 运行 GUI 版本 尤金
- 帮帮我 打印使用消息简要总结所有命令行选项和程序
版本，然后退出。
- 执照
转储许可证信息
--任务= or 模式名称> [架构选项]
运行给定的工作流架构
--状态栏隐藏
不显示任务状态栏
--ini文件=
加载自定义 UGENE 设置文件
--log-no-show-level
不要在日志中显示消息级别
--日志无显示日期
不要在日志中显示日期和时间信息
--log-no-show-类别
不要在日志中显示消息类别
--日志级别跟踪
显示跟踪日志消息
--日志级别-无
不显示日志消息
--日志级别信息
显示错误和信息日志消息（默认）
--日志级别错误
仅显示错误日志消息
--日志级别详细信息
显示详细信息日志消息
--日志颜色输出
彩色输出消息
--task-remote-machine=
在给定的远程机器上运行提供的任务
--ugene-活着
完成给定任务后不要停止 ugene
--transl=
加载指定语言的翻译。 语言被指定为两个字母的 ISO
639语言代码
指令
尤金 具有最重要功能的命令。 命令可以作为
尤金 [命令参数]
尤金 --任务= [命令参数]
查看每个正在运行的命令的帮助 尤金 --帮助= .
可以使用转储可用命令列表 尤金 - 帮助。
使用 onworks.net 服务在线使用 ugene
