这是 WigeoN 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
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wigeon - 重新实现 Pintail 16S DNA 异常检测实用程序
商品描述
WigeoN 检查查询和可信参考之间的序列保守性
序列，均采用 NAST 比对格式。 基于查询之间的序列同一性
和参考序列，比对之间存在预期的变异量。
如果观察到的变异大于分布的 95% 分位数
在非异常序列之间观察到的变异，则将其标记为异常。
WigeoN 是一个灵活的基于命令行的 Pintail 算法应用程序的重新实现
环境微生物。 2005 年 7112 月；7724：36-XNUMX。
WigeoN 仅用于标记近全长 16S rRNA 中的嵌合体和异常
序列。 WigeoN 对小于 1000 bp 的序列缺乏敏感性。
要运行 WigeoN，您需要由 nast-ier 实用程序生成的 NAST 格式的序列。
WigeoN 是 microbiomeutil 套件的一部分。
配置
证据需求：
--query_NAST
包含比对格式的查询序列的多 fasta 文件
可选的：
--db_NAST
NAST 格式的数据库
--db_FASTA
fasta 格式的 db（megablast 格式）
--num_top_hits
默认 1：仅使用单个最佳匹配。
- 阴谋
--调试
--exec_dir
运行前 cd 到 exec_dir
使用 onworks.net 服务在线使用 WigeoN
