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wossdata - 通过 EDAM 数据查找程序

概要

数据 -标识符 绳子 [-爆炸 布尔[-显示关键字 布尔] -敏感 布尔
-子类 布尔 -过时的 布尔 -浮雕 布尔 -大使馆 布尔
-表演大使馆 绳子 -冒号 布尔 -gui 布尔 [-输出文件 输出文件[-html 切换]
[-组 布尔[-alphabetic 布尔]

数据 -救命

商品描述

数据 是来自 EMBOSS（“欧洲分子生物学公开赛”）的命令行程序
软件套件”）。 它是“Ontology:EDAM,Documentation”命令组的一部分。

配置

输入 部分
-标识符 绳子

额外 部分
-爆炸 布尔
EMBOSS 应用所属的群体有两种形式，爆炸式和非爆炸式
爆炸了。 爆炸的组名数量更多，而且往往措辞含糊
未爆炸的那些。 分解的名称由组的定义形成
名称以 NAME1:NAME2 开头，然后扩展为多种组合
名称为：'NAME1'、'NAME2'、'NAME1 NAME2'、NAME2 NAME1'。 非扩展名
就像：'NAME1 NAME2'。 默认值：N

-显示关键字 布尔
默认值：N

先进的 部分
-敏感 布尔
默认情况下，查询关键字与 EDAM 术语名称（和同义词）匹配
只要。 此选项还根据 EDAM 术语定义匹配关键字，并将
因此（通常）报告更多匹配项。 默认值：N

-子类 布尔
扩展查询匹配以包括所有专业化术语 (EDAM
子类）的匹配类型。 默认值：是

-过时的 布尔
默认行为是不使用或返回过时的术语。 如果设置此选项将
包括所有条款。 默认值：N

-浮雕 布尔
如果您使用此选项，则将搜索 EMBOSS 程序文档。 如果这
选项设置为 false，则只会搜索 EMBASSY 程序（如果
-使馆选项为真）。 EMBASSY 程序严格来说并不是 EMBOSS 的一部分，而是使用
相同的代码库并共享相同的外观和感觉，但通常是开发的
由希望程序在 GNU 通用公共许可证计划之外的人
默认值：是

-大使馆 布尔
如果您使用此选项，则将搜索 EMBASSY 程序文档。 如果这
选项设置为 false，则只会搜索 EMBOSS 程序（如果
-emboss 选项为真）。 EMBASSY 程序严格来说并不是 EMBOSS 的一部分，而是使用
相同的代码库并共享相同的外观和感觉，但通常由
希望程序在 GNU 通用公共许可证计划之外的人
默认值：是

-表演大使馆 绳子
如果您使用此选项，则此 EMBASSY 包程序文档将是
搜索。 EMBASSY 程序严格来说不是 EMBOSS 的一部分，但使用相同的代码
库并共享相同的外观和感觉，但通常由以下人员开发
希望程序在 GNU 通用公共许可证计划之外

-冒号 布尔
EMBOSS 应用程序最多属于两个级别的组，例如
主要组“对齐”有几个子组或二级组，例如：
共识、差异、点图、全球、本地、多重。 帮助程序解析
需要这些子组名称的 wossname 的输出，冒号 ':' 将是
如果此选项为真，则放置在组名的第一级和第二级之间。
注意：如果组名已用“爆炸”展开，则这不适用
选项。 默认值：N

-gui 布尔
此选项旨在帮助那些设计图形用户界面的人
EMBOSS 应用程序。 一些 EMBOSS 程序不适合在 GUI 中运行，
其中包括其他菜单程序和交互式编辑器。 此选项允许您
只报告那些可以从 GUI 运行的程序 默认值：N

输出 部分
-输出文件 输出文件
默认值：标准输出

HTML 部分
-html 切换
如果您将输出发送到文件，这将格式化它以显示为表格
在 WWW 文档中。 默认值：N

-组 布尔
如果使用此选项，则只会将组名输出到文件 Default
值：N

-alphabetic 布尔
如果您使用此选项，那么您将获得一个程序名称列表和
描述而不是在其功能组中列出的程序。 默认
值：N

使用 onworks.net 服务在线使用 wossdatae