这是名为 AMBIENT 的 Linux 应用程序，可在 Linux 上在线运行，其最新版本可以作为ambient-1.3.tar.gz 下载。它可以在免费的工作站托管提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 AMBIENT 的应用程序，以便通过 OnWorks 免费在 Linux 中运行。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
AMBIENT 在 Linux 中在线运行
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商品描述
重要提示：自从 BMC Sys Bio 中的 AMBIENT 方法发布以来，已经进行了多次更新。 如果您希望使用本文中使用的版本，它是 v0.6.3，但我建议使用最新版本，它的工作方式相同，但具有附加选项，并且具有稳定性和性能改进。 感谢您的关注！AMBIENT (Active Modules for Bipartite Networks) 是一个 Python 模块，它使用模拟退火来查找具有某些一致特征的代谢网络（模块）区域。 AMBIENT 不需要预先定义的途径，并提供对代谢受影响区域的高度特异性预测。
例如，可以在网络中使用基于其注释编码基因转录数据的反应分数，并且可以找到协调表达变化的模块。 这为通路/基因集富集分析提供了一种替代方案，同时更加灵活和具体。
目的
学术/科研
程式语言
Python
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/ambient-bio/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
