这是名为 AmpliMethProfiler 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 AmpliMethProfiler_1.2.tar.gz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 AmpliMethProfiler 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
AmpliMethProfiler
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商品描述
ampliMethProfiler 工具提供了一种简单且用户友好的方法来提取和分析来自靶向亚硫酸氢盐测序实验的读数的表单倍型组成。具体而言,ampliMethProfiler 提供了一种简单且用户友好的方法来提取和分析来自靶向亚硫酸氢盐测序实验的读数的上等位基因组成。 ampliMethProfiler 是用 python 语言编写的,需要在本地安装 BLAST 和 QIIME 工具。 它可以在 Linux 和 OS X 平台上运行。
如何引用我们:
“ampliMethProfiler:用于分析靶向深亚硫酸氢盐测序扩增子的 CpG 甲基化谱的管道”。 斯卡拉 G.,等。 BMC 生物信息学 (2016) 17:484,
DOI: 10.1186/s12859-016-1380-3
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/amplimethprofiler/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。