这是一个名为 ChIP-RNA-seqPRO 的 Linux 应用程序，可在 Linux 在线运行，其最新版本可以作为 cloudclientID.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 ChIP-RNA-seqPRO 的应用程序，可在 Linux 上免费运行 OnWorks。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
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ChIP-RNA-seqPRO 在 Linux 上在线运行
商品描述
ChIP-RNA-seqPRO：一种识别与异常转录剪接和 RNA 编辑位点相关的表观遗传失调区域的策略。 与自定义注释库、演示数据输入和 README 指南打包在一起的可运行 python 脚本。9/26：v1.1 更新了 MAIN_IV 以调试由不再支持“子集”的 python pandas 引发的错误。
此处不再主动维护/更新此代码。 用于比较分析表观遗传、序列变异和表达数据集的基于云的资源现已可用。 请访问 Cloudomics，基于云的资源项目： https://sourceforge.net/projects/cloudomics-for-aws/
特性
- 用于比较分析各种表观基因组（ChIPseq、MBDseq 等）和基于 RNA 的测序配对样本数据集的工具
- 如果您使用此工具或任何注释库，请包括以下参考：Champion M.、Hlady R.、Yan H.、Evans J.、Nie J.、Lee J.、Bogenberger J.、Nandakumar K.、Davila J.、Moore R.、Nair A.、O'Brien D.、Zhu Y.、Kortüm K.、Ordog T.、Zhang Z.、Joseph R.、Kocher J.、Jonasch E.、Robertson K.、Tibes R. 和 H. Ho T. (2015)。 识别与异常转录剪接和 RNA 编辑相关的表观遗传失调区域的生物信息学策略。 在国际生物信息学模型、方法和算法会议论文集，第 163-170 页。 DOI：10.5220/0005248001630170
目的
学术/科研
程式语言
Unix 外壳，Python
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/chiprnaseqpro/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
