这是一个名为 CNVision 的 Linux 应用程序,可在 Linux 在线运行,其最新版本可以作为 CNVision.tar.gz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 CNVision 的应用程序,可免费使用 OnWorks 在 Linux 中在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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CNVision 在 Linux 上在线运行
商品描述
CNVision 是一个 Perl 脚本,它通过 PennCNV、QuantiSNPv300 和 GNOSIS(一种内置算法)运行 Illumina 基因分型数据(从 2.3k 到最新 Omni 的所有芯片)。 它合并结果并评估原始数据的质量。 CNVision 还可以使用高度准确的算法在基于家族的数据中从头识别 CNV,该算法根据原始基因分型数据考虑任一亲本中 CNV 的可能性。该脚本经过优化,可在基于 UNIX 的环境中工作; 它应该可以在 Windows 中运行,但是运行 PennCNV 组件会在使用较新版本的 PennCNV 时出错。
编写 CNVision 是为了分析 Simons Simplex Collection (SSC) 自闭症数据的数据。 以下论文中给出了方法的填充描述,可用于参考CNVision:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21658581
目的
学术/科研
用户界面
控制台/终端
程式语言
Perl的
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/cnvision/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。