这是名为 COPEread 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为cop-v1.2.5.tgz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并在线运行这个名为 COPEread 的应用程序和 OnWorks。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
COPE阅读
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商品描述
COPE(Connecting Overlapped Pair-End read)是一种将illumina测序的Pair-End read比对和连接的方法,其中insert size小于两个read长度之和。连接后的reads可用于基因组组装、重测序和转录组研究。
完整引用:
COPE:一种基于 k-mer 的精确双端读取连接工具,可促进基因组组装
刘炳航; 袁剑英; 姚小明; 李振宇; 谢银龙; 陈彦祥; 于建石; 张浩; 李英瑞; 林德华; 罗瑞邦
生物信息学 (2012) 28(22): 2870-2874; doi:10.1093/生物信息学/bts563
特性
- 连接重叠的对端读取
程式语言
C + +中
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/coperead/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。