这是一个名为 EXCAVATOR-tool 的 Linux 应用程序，可在 Linux 在线运行，其最新版本可以作为 EXCAVATOR_Package_v2.2.tgz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 EXCAVATOR-tool 的应用程序，可免费使用 OnWorks 在 Linux 中在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
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EXCAVATOR-工具在Linux上在线运行
商品描述
注意！！！！！！注意！！！！！！注意！！！！！！注意！！！！！！我们最近在 BMC Genomics 上发表了一个名为 XCAVATOR 的新软件包，用于从短读和长读全基因组测序实验中识别 CNV/CNA。https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-017-4137-0).
XCAVATOR 可在以下网址免费获得 http://sourceforge.net/projects/xcavator/.
EXCAVATOR 是一种新颖的软件包，用于从全外显子组测序数据中检测拷贝数变异 (CNV)。
挖掘机已发表在基因组生物学（http://genomebiology.com/2013/14/10/R120/abstract).
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注意力！！！！！ 为了正确使用 EXCAVATOR 工具，用户必须在以下链接下载 uniqueome 可映射性文件：
http://grimmond.imb.uq.edu.au/uniqueome/downloads/hg19_uniqueome.coverage.base-space.25.1.Wig.gz （对于 hg19）
http://grimmond.imb.uq.edu.au/uniqueome/downloads/hg18_uniqueome.coverage.base-space.25.1.Wig.gz
特征
- 下一代测序
- 拷贝数变体
- 全外显子组测序
程式语言
Perl的
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/excavatortool/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
