这是名为 Generalized Pattern Matching 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 longpattern.exe。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并在线运行这个名为 Generalized Pattern Matching with OnWorks 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
广义模式匹配
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商品描述
该工具旨在解决广义模式匹配问题,我们只找到一组子模式,忽略子模式之间的间隙。 这个工具速度非常快,并且对错误也有很好的容忍度。
特征
- 在一分钟内完成人类基因组的模式匹配
- 基于硬盘的 k-mers 索引
- 互补双播
- 在扩展中修剪 DP
- 短种子长度 k 具有良好的容错性
- 可以处理正负差距
目的
高级最终用户
用户界面
命令行
程式语言
C
数据库环境
其他API
分类目录
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/gpatternmatch/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便通过我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。