这是一个名为 iPiG 的 Linux 应用程序,可在 Linux 在线运行,其最新版本可以作为 ipig_r5.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 iPiG 的应用程序,可在 Linux 上免费运行 OnWorks。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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iPiG 在 Linux 上在线运行
商品描述
iPiG 的目标是整合来自质谱 (MS) 的肽谱匹配 (PSM)将肽识别到基因组浏览器(例如 UCSC 基因组浏览器)提供的基因组可视化中(http://genome.ucsc.edu/).
iPiG 从 MS 标准格式 mzIdentML (*.mzid) 或文本格式中获取 PSM,并以基因组跟踪格式(BED 和 GFF3 文件)提供结果,这些格式可以轻松导入到基因组浏览器中。
有关 iPiG 及其功能的更多详细信息,请参阅
“iPiG:将肽谱匹配整合到基因组浏览器可视化中”
Mathias Kuhring 和 Bernhard Y. Renard
(http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0050246)
目的
学术/科研
用户界面
Java Swing,控制台/终端
程式语言
爪哇岛
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/ipig/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。