这是名为 JSiteDescriptor 的 Linux 应用程序，其最新版本可以下载为 binaries.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 JSiteDescriptor 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
JSiteDescriptor
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商品描述
一组从 PDB 文件中提取坐标和化学信息的 Java 程序。
使用基于网格的方案提取结合位点区域。
对于结合位点，空间化学描述符是基于 Kalidas 博士（也是该项目的作者）的 PocketMatch 算法生成的。
功能
- 为绑定站点生成基于 PocketMatch 的矢量描述符
- 在单个 PDB 文件模式或批处理模式下运行
- 位点作为配体邻域的规范 -（配体代码、名称和链 ID）
- 使用正则表达式将站点指定为 PDB 子集邻域
- 结合位点内衬的多个原子范围的规范
- 批处理模式处理文件通过XML文件捕获输入参数+符合XSD规范
- 更好的可配置性 - 站点的残基组选择、半径和类别
- 用于 GUI 的 Java Swing 技术
- 用于未来开发的简单且可扩展的软件架构
目的
学术/科研
用户界面
Java秋千
程式语言
爪哇岛
分类
生物信息学
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/jsitedescriptor/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
