这是名为 lr2rmats 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 lr2rmats-v0.1-alpha.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 lr2rmats 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
Ad
LR2rmats
商品描述
lr2rmats 是一个基于 Snakemake 的轻量级管道,旨在利用第三代长读和第二代短读 RNA-seq 数据生成增强的基因注释文件。 新生成的注释文件可以提供给 rMATS 进行差异选择性剪接分析。
更多的信息可以在这里找到 https://sourceforge.net/p/lr2rmats/wiki/Home/
特性
- 长读
- RNA序列
- 替代拼接
- 太平洋生物科学
- 牛津纳米孔技术
目的
学术/科研
用户界面
命令行
程式语言
Unix Shell、Python、C
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/lr2rmats/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。