这是一个名为 MANTI.pl/muda.pl 的 Linux 应用程序,可在 Linux 在线运行,其最新版本可以下载为 muda.pl-v3.6.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行此名为 MANTI.pl / muda.pl 的应用程序,可免费使用 OnWorks 在 Linux 上在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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MANTI.pl/muda.pl 运行在Linux在线
商品描述
-------- 注意开始:重命名muda.pl 在 v3.7 中更名为 MANTI.pl,项目开发可以在 MANTI 项目页面上跟踪 sourceforge.net. 旧版本保留在这里用于存档目的。
--------注意完
muda.pl 是一个评估脚本(用 Perl 编写),没有很大的依赖性。
它将来自 4 个不同 MaxQuant 输出文件的信息聚合到一个主文件中,该文件明确适用于蛋白质新末端分析。 数据集合的中心锚点是 modifySpecificPeptides.txt 文件 - 附加数据是从 MaxQuant txt 文件夹中的不同其他源文件推断出来的,但数据组装的起点仅是 modifySpecificPeptides.txt 文件。 也许对于正常的蛋白质组学目的也很有用,但该脚本针对蛋白质新末端识别和验证进行了大量优化。
有关脚本参数和评估策略的更详尽说明,请参阅详尽的手册 PDF。
功能
- MaxQuant 数据评估
- 蛋白质末端鉴定和验证
- UniProt 数据注释和组装
- 将识别的 Termini 重新映射到同种型
- Limma、LOCALIZER 和 TopFINDer 集成
- 有据可查
目的
学术/科研
用户界面
命令行
程式语言
Perl的
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/muda/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。