这是一款名为 oxDNA 的 Linux 应用程序，可在 Linux 在线运行，其最新版本可以下载为 oxDNA_2.4_RJUNE2019.tgz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 oxDNA 的应用程序，可免费使用 OnWorks 在 Linux 中在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
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oxDNA 在 Linux 上在线运行
商品描述
oxDNA 是一个模拟代码，最初被设想为由 TE Ouldridge、JPK Doye 和 AA Louis 引入的粗粒度 DNA 模型的实现（http://dx.doi.org/10.1063/1.3552946）。 它已经过重新设计，现在是一个可扩展的模拟+分析框架。 它原生支持 CPU 和 NVIDIA GPU 上的 DNA、RNA、Lennard-Jones 和斑块粒子模拟。功能
- 分子动力学和布朗动力学
- 蒙特卡洛（NVT、NPT，有或没有虚拟移动）
- 独立的单链和双链发电机
- 用于 DNA 折纸的 Cadnano 转换器
- 支持 NVIDIA GPU 模拟
目的
学术/科研
程式语言
C + +中
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/oxdna/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
