这是名为 PARSEC - PAtteRn SEarch / Context 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 PARSEC_Deployment_Package_v2.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并在线运行这个名为 PARSEC - PAtteRn SEarch / Context with OnWorks 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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PARSEC - 模式搜索/上下文
商品描述
基因组位点的表征是理解和利用下一代测序数据的主要挑战。 大多数基因组位点由具有分散分布的短简并基序表示,有时还具有生物学功能(例如:基因表达的调节、剪接模式或表观遗传学信号)。 这些基序与大量噪声相关,因此,用于准确检测基因组位点的计算平台的开发需要整合各种大规模生物数据以滤除误报。
PARSEC 代表了一种直观、模块化(易于扩展)和一体化的解决方案,用于有效集成大量不同的基因组信息,以便在用户友好的环境中对生物位点进行非线性定位和表征。
有关硬件要求和支持的浏览器,请参阅 wiki。
目的
学术/科研
用户界面
基于网络的
程式语言
C++、Java
数据库环境
JDBC、MySQL、PostgreSQL (pgsql)
分类目录
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/genomicparsec/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。