这是名为 Pathoscope 的 Linux 应用程序，其最新版本可以下载为 pathoscope_2.0.6_clinical_pathoscope_1.0.3.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并在线运行这个名为 Pathoscope with OnWorks 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
病理镜
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商品描述
此页面用于存档目的。 软件最新版本请访问github： https://github.com/pathoscopePathoScope 从混合样本中获取下一代测序读数，并预测存在哪些基因组。 我们使用贝叶斯框架结合基于初始参考的比对将读数分配给正确的起源基因组。
病理镜 2.0：
维基：
http://sourceforge.net/p/pathoscope/wiki/Home/
教程：
http://sourceforge.net/projects/pathoscope/files/pathoscope2.0_v0.02_tutorial.pdf
临床病理镜版本： http://sourceforge.net/p/pathoscope/wiki/clinical_pathoscope/
PathoQC 下载： http://sourceforge.net/projects/pathoscope/files/pathoqc_v0.1.4.tar.gz/download
出版物： http://www.microbiomejournal.com/content/2/1/33
http://www.biomedcentral.com/1471-2105/15/262
http://genome.cshlp.org/content/23/10/1721
客户支持：
PS：有任何问题请发邮件到bu dot edu的mani2012。
特征
- PathoQC：PathoQC 是用于高通量数据集的质量控制和预处理独立程序。 请从以下位置下载 PathoQC http://sourceforge.net/projects/pathoscope/files/pathoqc_v0.1.4.tar.gz/download
- PathoQC 出版物： http://la-press.com/article.php?article_id=4828
- 客户支持： https://groups.google.com/d/forum/pathoscope
- 实验室页面： http://jlab.bu.edu/software/
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/pathoscope/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
