这是名为 PBSuite 的 Linux 应用程序，其最新版本可以作为 PBSuite_15.8.24.tgz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 PBSuite 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
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套件
商品描述
目前，这里托管着由 Adam English 创建和维护的两个项目。
PBJelly - 基因组升级工具。
PBHoney - 结构变异发现工具
两者都包含在下载中的 PBSuite 代码中。
----- PB果冻 -----
阅读论文
http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0047768
PBJelly 是一种高度自动化的管道，可将长测序读取（例如 PacBio RS 读取或 fasta 格式的长 454 读取）与高置信度草图组装对齐。 PBJelly 尽可能多地填充或减少捕获的空白，以生成升级的基因组草图。
----- PB 蜂蜜 -----
阅读论文
http://www.biomedcentral.com/1471-2105/15/180/abstract
PBHoney 是两种变体识别方法的实现，旨在利用长读取（即大于 10,000 bp）的高可映射性。 PBHoney 考虑读内不一致和长读长的软剪尾来识别结构变异。
特性
- 基因组组装
- 基因组升级
- 结构变异
- 装配评估
目的
学术/科研
程式语言
Python
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/pb-jelly/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
