这是名为 Pontos 的 Linux 应用程序，其最新版本可以作为 Pontos-3.0-src.zip 下载。它可以在免费的工作站托管提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 Pontos 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
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商品描述
Pontos 是一个易于使用的图形化 Java 程序，用于从 PHYLIP 格式的 DNA 序列比对中计算未校正的距离（或相似性）矩阵。 它还创建与常规对齐的“差异”对齐（反之亦然）。
它可以以不同的方式处理差距和歧义。
差距可以是：
- 全部使用；
- 全部忽略；
- 仅在序列末尾以成对方式忽略；
- 仅在末端忽略，但现在全局忽略（实际上将整个对齐修剪为距末端最远的序列）。
歧义（例如 DNA 序列中的 R、Y、N、W 等）可以这样处理：
- 将歧义视为总是不同的；
- 将歧义视为部分不同（例如，R 与 A 或 G 相差 0.5）；
- 忽略每个成对比较中的歧义；
- 全局删除所有显示任何歧义的列。
Pontos 是用 Linux 编写的，但应该可以在任何运行 Java 的系统中运行。 Pontos 在 GPL 版本 3 下获得许可。
目的
科学/研究，最终用户/桌面
用户界面
Java秋千
程式语言
爪哇岛
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/pontos/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
