这是名为 Protospacer Workbench 的 Linux 应用程序，其最新版本可以作为 Protospacer_Workbench.MacOSX.64bit.tar.gz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并运行这个名为 Protospacer Workbench with OnWorks 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
Ad
原型间隔工作台
商品描述
Protospacer Workbench 有助于设计、分析和共享任何生物体或一组 FASTA 格式序列的 CRISPR 目标位点。CRISPR/Cas 基因组编辑系统的引导 RNA 设计直观上很容易，但在计算上却很困难。 主要困难来自需要识别可能与预期目标完全不同的潜在脱靶。 当前用于引导 RNA 设计的在线工具为诸如 Bowtie 或 BLAST 等序列映射软件提供了一个用户友好的界面。 然而，虽然速度很快，但这些映射算法的设计对错误的容忍度并不高，这是确定潜在脱靶的关键特征。 在线工具失败的地方，离线工具成功。 然而，离线工具需要命令行的知识，而很少有使用 CRISPR 的人拥有这些知识。 Protospacer Workbench 旨在弥合在线和离线引导 RNA 设计之间的差距。 该软件目前可用于 OS X，并将很快移植到其他操作系统。
特征
- 快速找到所有可用的 CRISPR 目标
- 彻底评估向导 RNA 设计
- 共享目标和指导 RNA 列表
- 为任何有机体设计
- 管理多个数据库
- 分步工作流程
- 获取有关预期向导 RNA 性能的报告
- 从一个界面使用多个第三方工具
- 多目标设计
- 管理大型目标/指导RNA列表
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/protospacerwb/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
