这是名为 PSOVina 2.0 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 POSE_PREDICTION.tar.gz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 PSOVina 2.0 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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PSOVina 2.0
商品描述
基于粒子群智能高效优化算法和AutoDock Vina框架的快速对接工具。 基于最初的 PSO 实施,我们的 PSOVina 方法经历了几项重要的改进,以提高对接精度并与原始 AutoDock Vina 相比实现显着的效率。特征
- 比 AutoDock Vina 快得多,具有更好或相似的准确度
- 适用于蛋白质配体对接和虚拟筛选
- 最新版本 PSOVina-2.0 在全局搜索中嵌入了 Singer 混沌函数,在局部搜索中嵌入了高效的 2-stage 方法
- 比 Vina 实现 6-7 倍的加速
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/psovina/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。