这是一个名为 QUAST 的 Linux 应用程序,可以在 Linux 在线运行,其最新版本可以作为 quast-5.0.2.tar.gz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 QUAST 的应用程序,可免费使用 OnWorks 在 Linux 中在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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QUAST 在 Linux 上在线运行
商品描述
QUAST 对基因组组装进行快速方便的质量评估和比较。QUAST 计算了许多众所周知的指标,包括重叠群准确度、发现的基因数量、N50 等,以及引入新指标,如 NA50(请参阅论文和手册中的详细信息)。 综合分析产生汇总表(纯文本、制表符分隔和 LaTeX 格式)和彩色绘图。 该工具还生成基于 Web 的报告,将所有信息浓缩到一个易于浏览的文件中。
QUAST 具有直观的命令行界面和详细的手册,可帮助用户运行它并了解其输出。 此外,实验室在 http://quast.bioinf.spbau.ru/ 这使得质量评估更加简单。
QUAST 和 MetaQUAST(宏基因组组装扩展)论文发表在 Bioinformatics 上。
特性
- 基于网络的报告、纯 txt 表格、制表符分隔和 LaTeX 格式
- 彩色图和直方图
- 使用和不使用参考基因组的质量评估
- 宏基因组组装的质量评估
- 交互式重叠群浏览器
目的
科学/研究、开发人员、最终用户/桌面
用户界面
基于 Web 的命令行
程式语言
蟒蛇,JavaScript
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/quast/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。