这是名为 RGAAT 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 RGAAT.tar.gz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 RGAAT 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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RGAAT
商品描述
该程序可以使用序列比对文件(SAM 或 BAM 格式)、序列变异文件(VCF 格式或五色列表(制表符分隔,包括染色体、位置、id、参考)为新基因组和已知基因组升级组装和/或注释基因组等位基因和替代等位基因))或基于参考基因组序列文件(FASTA 格式)和注释文件(TBL、GTF、GFF、GFF3 或 BED 格式)的新基因组序列文件(FASTA 格式)。
特征
- 序列变异鉴定
- 基因组共有序列构建
- 基因组修饰
- 基因组比较
- 基因组注释
- 构建不同基因组组装版本之间的基因组坐标转换
目的
学术/科研
程式语言
Perl的
分类目录
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/rgaat/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。