这是一个名为 SnowyOwl 的 Linux 应用程序，其最新版本可以下载为 SnowyOwl-2.0.3.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 SnowyOwl 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
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雪鸮
商品描述
SnowyOwl 是一个基因预测管道，它使用 RNA-Seq 数据来训练并为基于隐马尔可夫模型 (HMM) 的基因预测的生成提供提示，并评估生成的模型。 通过将其预测与三个真菌基因组中手动管理的基因模型进行比较，该管道已得到验证和简化，其结果显示灵敏度和选择性比以前的基因预测显着增加。 通过使用不同的输入参数重复运行 HMM 基因预测器 Augustus 来获得灵敏度，并通过选择与已知蛋白质具有最佳同源性和与 RNA-Seq 数据最一致的模型来获得选择性。 SnowyOwl 已成功预测了 26 个新真菌基因组中的基因。
管道可以在本地安装以实现高吞吐量和对配置的控制。 它也可以通过方便的 Web 界面在远程服务器上运行，以供偶尔使用。
特征
- 使用 RNA-Seq 数据进行基因预测
- 高灵敏度和特异性
- 使用手动策划的基因模型简化和验证管道
- 高度可配置
- 子囊菌和担子菌真菌的默认配置
- 在本地安装和运行以实现控制和灵活性
- 为方便起见，通过 Web 界面远程运行
目的
科学/研究，高级最终用户
用户界面
基于 Web、命令行、GTK+
程式语言
蟒蛇，PHP
分类目录
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/snowyowl/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
