这是名为 Subread 的 Linux 应用程序，其最新版本可以下载为 subread-2.0.4-Windows-x86_64.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并在线运行这个名为 Subread with OnWorks 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
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商品描述
Subread 软件包是用于处理下一代测序数据的工具包。 它包括 Subread aligner、Subjunc 外显子-外显子结检测器和 featureCounts 读取汇总程序。
Subread aligner 可用于对齐 gDNA-seq 和 RNA-seq。 Subjunc aligner 专为检测外显子-外显子连接而设计。 对于 RNA-seq 读数的映射，Subread 执行局部比对，Subjunc 执行全局比对。 Subread 和 Subjunc 发表在以下论文中：Yang Liao、Gordon K Smyth 和 Wei Shi。 “Subread aligner：通过种子和投票进行快速、准确和可扩展的读取映射”，核酸研究，2013，41(10):e108
特性
- 读取对齐器
- 下一代测序
目的
学术/科研
用户界面
命令行
程式语言
C
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/subread/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
