这是名为 Visualization of Protein-Ligand Graphs 的 Linux 应用程序，其最新版本可以下载为 vplg_2016_07_18.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并在线运行这个名为 Visualization of Protein-Ligand Graphs with OnWorks 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
Ad
蛋白质-配体图的可视化
商品描述
蛋白质配体图 (VPLG) 软件包的可视化计算和可视化蛋白质图。 它适用于超二级结构级别，并使用来自 PDB 文件的原子坐标和 DSSP 算法的 SSE 分配。
VPLG 是命令行软件。 如果您不喜欢输入命令，请尝试我们的 PTGL Web 服务器： http://ptgl.uni-frankfurt.de/
特征
- 从 PDB 文件中读取 3 维原子数据并从 DSSP 文件中读取二级结构分配
- 根据数据计算蛋白质配体图并可视化该图
- 支持以位图 (.png) 和矢量 (.svg) 格式输出图形图像
- 以自己的格式 (.plg) 导出纯文本文件中的蛋白质配体图形，该格式易于使用计算机程序以及多种标准图形文件格式进行编辑、解析和生成
- 可以从 .plg 文件读取并直接可视化蛋白质图
- 免费开源软件 (FOSS)
- 数据库支持（完全可选，默认不需要数据库服务器）
- 命令行界面允许通过 shell 脚本轻松进行批处理
- 允许按原子数过滤配体
- 用 Java 编写的新 GUI，不再需要键入控制台命令！
- 支持 PTGL Web 服务器的软件： http://ptgl.uni-frankfurt.de/
目的
科学/研究、教育、高级最终用户
用户界面
Java Swing、控制台/终端、命令行
程式语言
爪哇岛
数据库环境
数据库连接
分类目录
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/vplg/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
