这是一款名为 WellMeth 的 Linux 应用程序,可在 Linux 在线运行,其最新版本可以下载为 wellmeth-1.0.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 WellMeth 的应用程序,可免费使用 OnWorks 在 Linux 中在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
WellMeth 在 Linux 上在线运行
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商品描述
WellMeth 是用于减少表示的亚硫酸氢盐-Seq 分析的集成框架特性
- 将基因分型测序 (GBS) 方法扩展到检测基因组 DNA 中的甲基化胞嘧啶
- 依赖于高质量参考基因组的可用性,建议使用两种甲基化不敏感酶进行文库构建的双重限制性消化
- 对于双端短读长测序,不对称正向和反向接头将应用 4 到 6 nt 长的条形码和与条形码相邻的固定数量的随机核苷酸(唯一分子标识符,UMI)
- UMI 信息将用于 PCR 重复的比对后识别
- 由四个重叠模块组成:预处理、映射、甲基化变异检测和差异甲基化
- 模块通过可定制的包装脚本相互连接,允许全自动执行
- 快速、准确、轻便
用户界面
控制台/终端
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/wellmeth/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。