这是名为 Genome Microsatellite Analyzing Tool 的 Windows 应用程序,其最新版本可以下载为 gmatoV1.2Build20130106.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 Genome Microsatellite Analyzing Tool 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从本网站启动任何 OS OnWorks 在线模拟器,但更好的 Windows 在线模拟器。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Windows 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序并安装。
- 7. 从您的 Linux 发行版软件存储库下载 Wine。 安装后,您可以双击该应用程序以使用 Wine 运行它们。 您还可以尝试 PlayOnLinux,这是 Wine 上的一个花哨界面,可帮助您安装流行的 Windows 程序和游戏。
Wine 是一种在 Linux 上运行 Windows 软件的方法,但不需要 Windows。 Wine 是一个开源的 Windows 兼容层,可以直接在任何 Linux 桌面上运行 Windows 程序。 本质上,Wine 试图从头开始重新实现足够多的 Windows,以便它可以运行所有这些 Windows 应用程序,而实际上不需要 Windows。
SCREENSHOTS
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基因组微卫星分析工具
商品描述
越来越多的巨大全基因组 (>1G) 的序列可用性不断增加,击败了当前现有的 SSR 分析工具。 Genome-wide Microsatellite Analyzing Tool (GMATo) 是一个新的强大的程序,用于更快地挖掘任何长度、任何大小的 SSR,以及基因组方面的全面统计分析,专为基于 Perl 脚本的巨大基因组而设计。 只需要一个输入文件,其中包含原始 fasta 格式的 DNA 序列和表格格式的输出文件,列出所有 SSR 位点信息和四个生物学家感兴趣的分类的统计分布。 GMATo 还具有 Java 脚本的简单图形用户界面和 Perl 的命令行界面,可在 Windows、Linux 和 Mac 等平台上运行,为生物学家和生物信息学家提供易于定制的参数控制。 软件 GMATo 是在巨大基因组中进行 SSR 表征的更好工具引用本文:Wang X. et al , Bioinformation [2013, 9(10):541-544]
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/gmato/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。