这是名为 Javamony 的 Windows 应用程序，其最新版本可以作为 Javamony.jar 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 Javamony 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从本网站启动任何 OS OnWorks 在线模拟器，但更好的 Windows 在线模拟器。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Windows 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序并安装。
- 7. 从您的 Linux 发行版软件存储库下载 Wine。 安装后，您可以双击该应用程序以使用 Wine 运行它们。 您还可以尝试 PlayOnLinux，这是 Wine 上的一个花哨界面，可帮助您安装流行的 Windows 程序和游戏。
Wine 是一种在 Linux 上运行 Windows 软件的方法，但不需要 Windows。 Wine 是一个开源的 Windows 兼容层，可以直接在任何 Linux 桌面上运行 Windows 程序。 本质上，Wine 试图从头开始重新实现足够多的 Windows，以便它可以运行所有这些 Windows 应用程序，而实际上不需要 Windows。
SCREENSHOTS
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Javamony
商品描述
基于不太成功的 Pysimony (https://sourceforge.net/projects/pysimony/)，同一个坚定的学生在系统发育问题上再次尝试。
Javamony 的调用方式如下：
java -jar Javamony.jar [input.fasta] [随机/逐步（起始树）] [引导程序数量] [外群分类单元 #1] [外群分类单元 #2] ...
Javamony 并不是一个有竞争力的系统发育推理程序，它让我有机会在学习解决和解决系统发育学中的基本问题的同时获得 Java 语言。 因此，为了我自己的教育利益，所有代码都是原创的。 当然，也可能有很多错误。
我分发 Javamony，就像我做 Pysimony 一样，希望它对其他人具有教育价值或至少是模糊的有趣。
即将推出的功能将是：
- 支持氨基酸序列
- 支持其他文件格式（例如 Nexus）
- 多线程
- 其他评分方法（例如最大似然）
特性
- 使用最大简约
- 读取 FASTA 输入文件（仅限 DNA）
- 用户建立的外群
- 随机和逐步添加起始树
- 使用 SPR（子树修剪和重新嫁接）树搜索
- 执行引导
- 输出具有引导程序支持和分支长度的标准 Newick 格式
- 使用引导程序支持绘制最终树
目的
科学/研究，教育
用户界面
命令行
程式语言
爪哇岛
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/javamony/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
